可扣抵稅額課徵補充保費引發反彈，再度讓補充保費是否合理的老話題浮出檯面，儘管衛福部強調，收費標準事前曾與財政部溝通，但財政部顯然背書得也有點心不甘、情不願。補充保費「狂收」雖暫解健保財務危機燃眉之急，但若無法合情合理，只怕引發更多民怨。

　兩稅合一制下的可扣抵稅額是否算是收入？學界、業者看法並不一致，雖然兩稅合一爭議不斷，前副總統蕭萬長日前也語重心長的建議「應廢除兩稅合一」，但在兩稅合一沒有廢除前，就是合法稅制，可扣抵稅額究竟能否可視為收入，當然應由財政部說了算，這也是為何企業主頻頻抱怨，但衛福部還是堅持以財政部背書做擋箭牌、強調「沒有問題」的原因。

　但據了解，財政部雖先前與衛生署溝通此事時，認為「可扣抵稅額」廣義上可視為收入，但也建議衛生署應參酌企業界聲音「寬容以對」，但可能因當時健保財務已瀕臨山窮水盡，沒有多餘迴旋空間，衛生署仍堅持開徵。企業界雖心有不甘，但也只能照章辦事。

　補充保費開徵雖替健保帶來額外收入、有效延緩健保財務惡化速度，根據衛福部粗估，起碼撐到105年應無太大問題，但羊毛出在羊身上，雇主健保負擔越來越沈重，只好繼續放緩薪資成長幅度，成為壓垮台灣勞工薪資難以大幅成長的眾多「稻草」之一。

　更值得注意的是，健保財務惡化速度雖放慢，並不代表健保財務已經改善，民眾高度關切的健保品質是否能提升，仍是大問號。

　舉例而言，健保給付造成市場割喉戰下，許多醫療院所採購藥品改按折扣高低、而非品質高低，民眾在不知情下吃了不少折扣高、未通過PIC/S GMP（國際醫藥品稽查協約組織標準）認證藥廠生產的藥品，更遑論PIC/S GMP還只是起碼低標，還不一定就是高品質保證。試問，若民眾繳了更多保費，但健保陳年老問題仍原地踏步，當政府說未來要繼續再推健保新改革，還會有人相信嗎？可能得到支持嗎？