我國個人綜合所得稅是以「家戶所得」為課稅範圍、以「戶」為課稅單位，即同一家庭成員的所得必須全部合併，在同一張申報書上計算稅額並申報，不能分開。

但在累進課稅的機制下，夫妻按照家戶所得合併計稅精神，即會出現稅負上升的效果，形成「婚姻懲罰」現象。為避免夫妻因婚姻關係導致加稅，稅法賦予夫妻2種報稅選擇權，一是全部所得合併計稅，另外則是就其「薪資所得」分開計稅、合併報繳。

現行所謂「夫妻薪資分開計稅、合併申報」，是先將夫或妻的薪資單獨抽出，減除其個人免稅額與薪資扣除額，按適用稅率換算出配偶的薪資稅額後，再與家庭其他所得應納稅額合計成總稅額，在同一張申報書中申報繳稅。

不過，現制只准夫或妻的薪資分開計稅，其他非薪資收入仍須合併計稅，外界認為，現制僅解決雙薪家庭稅負上升問題，夫妻租稅懲罰現象並未完全消除。

大法官一紙釋憲令，迫使不再輕言減稅的財政部做出減稅150億元的決定，嘉惠族群名為全體夫妻合併報稅家庭，但真正受惠者其實只占現有夫妻申報案件的15%，且多數都是高收入家庭。

2012年1月20日，大法院會議做出696號解釋，宣告夫妻「非薪資所得」強制合併計稅的規定，有加重對婚姻懲罰的現象，違反憲法第7條平等原則，須在解釋公布後至遲2年內失效。

大法官會議解釋等同法律，財政部必須在期限屆滿前，提出所得稅法修正案，以修補現行夫妻合併申報產生的租稅上升效應。

但是，自1989年12月30日所得稅法第15條修正，准許夫妻可就其薪資所得分開計稅之後，稅制對夫妻的婚姻懲罰度已大幅下降。特別是多數以薪資為主要收入的家庭不再有加重稅負的感受。大法官會議696號解釋，與其說是解除了夫妻報稅之痛，不如說是鬆綁了高所得夫妻的重稅義務。

就在美國政府為解決「財政懸崖」危機，決定對富有家庭提高所得稅率至39.6%之際，台灣挾消除夫妻懲罰之名，行對富有家庭減稅之實作法，似乎違反國際潮流與社會觀感，這將是財政部「夫或妻各類所得完全分開計稅」新制，所引發最大爭議。

「婚姻懲罰稅」將成為歷史。明（103）年起，夫妻包括薪資、股利、執行業務等10大類所得，將可完全分開計稅。國庫預計釋放約150億元減稅利益，現有550萬個申報家庭中，屬夫妻申報者均可受惠，但減稅利益集中高所得家庭，雙薪之家獲利相對有限。

這是財政部配合大法官會議第696號解釋，指出現有夫妻計稅方式違憲，所做的重大租稅改革。這也是財政部宣布不再輕易動用減稅工具後，近年最龐大的減稅案。

財政部已經提出所得稅法第15條修正案，並送行政院審查，預計今年上半年完成立法，明年1月1日施行。修正案賦予夫妻擁有第3種報稅選擇權，准許納稅人本人及配偶的各類所得均可分開計稅，不再只限薪資所得，但夫妻仍需共用同一張申報書申報所得稅。

目前夫妻申報所得稅，只有「全部所得合併」與「夫或妻薪資單獨計稅」兩種選擇。依規劃，未來新增「夫或妻的各類所得均可分開計稅」第3種有利選擇。

採取全部所得分開計稅的家庭，配偶僅得減除與單獨計稅所得相關的「專屬扣除額」，如個人免稅額、薪資扣除額、身障扣除額與財產交易損失，其餘包括子女免稅額、房貸支出扣除額等，要由另一方申報減除。分開計稅下，夫妻共用1個27萬元儲蓄投資扣除額優惠維持不變。

「各類所得完全分開計稅」對醫師、律師、會計師等執行業務者、高股利投資族，以及薪資少但非薪資收入比重大的高所得家庭最有利，累進稅負將會下降。以薪資所得為主的雙薪中產家庭的減稅效果，相對不明顯，因現制已允許夫妻薪資可以分開計稅。新制之下，沒有家庭會出現稅負上升的不利情形，並可能因此受惠。